Wenn ich richtig informiert bin kam der Anime zuerst, und dann der Manga. Man kan den Anime also nicht für fehlende Szenen kritisieren (auch wenn deine Punkte ja echt nicht sehr schlimm sind), die im Manga waren. Wenn hat sich der Mangaka einfach gedacht, dass man noch etwas mehr hätte rausholen können, und das dann getan - auf sehr gute, feinfühlige Art und Weise, wie ich finde.
In gleichen Sinn ist Rebellion nicht wirklich ein "extra Animeteil", obwohl ich grundsätzlich zustimme das der Anime/Manga in sich geschlossen war. Persönlich fand ich Rebellion aber genial, von daher stört mich das eh nicht. Wäre cool, mal irgendwann deine Meinung dazu zu hören.